新开发的禾本科通用性分子标记的检测与评估

作     者：李兵娟 肖国辉 许在恩 郭小勤 LI Bingjuan;XIAO Guohui;XU Zaien;GUO Xiaoqin

作者机构：浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地浙江临安311300 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(30901155) 浙江省自然科学基金资助项目(Y307499) 

出 版 物：《浙江农林大学学报》 (Journal of Zhejiang A&F University)

年 卷 期：2014年第31卷第4期

页      码：508-514页

摘      要：为开发更多的适用于禾本科Poaceae植物通用性分子标记,丰富竹类植物的遗传信息,依据禾本科单拷贝同源基因(COSⅡ)已知序列的保守区域设计了14对引物,以此引物对刚竹属Phyllostachys植物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,并对部分扩增产物进行测序。结果所有引物可以在至少1个材料中得到特异性扩增,其中7对引物在5个供试材料中均能扩增到产物,13对引物在5个样本中表现出多态性,占引物总数的92.9%。对部分扩增产物进行测序,所测序列均为特异性扩增序列。同一引物在不同样本中的扩增片段间存在单核苷酸多态性(SNP)位点,部分SNP位点会导致氨基酸序列提前终止或酶切位点变化。对有合适内切酶存在的变异位点进行PCR-RFLP验证,验证结果与测序结果一致。利用NTsys 2.10e软件,对5个供试竹种材料进行了亲缘关系分析,毛竹Phyllostachys edulis与绿粉竹Phyllostachys virdiglaucescens亲缘关系最近,紫竹Phyllostachys nigra与其他4个竹种亲缘关系最远。所开发的14个COSⅡ引物在刚竹属植物中具一定通用性,同时挖掘出更多竹类植物中的遗传信息。

主 题 词：植物学 竹类植物 通用性分子标记 单拷贝同源基因(COSⅡ) 单核苷酸多态(SNP) 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 090701[090701] 0907[农学-草药学] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 

D　O　I：10.11833/j.issn.2095-0756.2014.04.003

馆 藏 号：203122759...