通过生物信息学方法分析脂肪酸合酶在肾透明细胞癌中的表达以及与肿瘤免疫细胞浸润的关系

作     者：张琳 王东文 吴波 ZHANG Lin;WANG Dongwen;WU Bo

作者机构：山西医科大学第一临床医学院太原030001 山西医科大学第一医院泌尿外科 国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院深圳医院泌尿外科 

基　　金：国家自然科学基金(81970662) 山西省“1331工程”重点创新团队建设计划(3c332019001) 国家癌症中心重点课题(SZ2020ZD-003) 山西省研究生教育创新项目(2023SJ142) 山西省基础研究计划(20210302123242) 北京白求恩公益基金会,泌尿肿瘤专项研究基金(mnzl202029) 

出 版 物：《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 (Journal of Contemporary Urologic and Reproductive Oncology)

年 卷 期：2023年第15卷第4期

页      码：197-202,207页

摘      要：目的通过生物信息学方法探讨肾透明细胞癌(cc RCC)中脂肪酸合酶(FASN)基因和蛋白的表达水平及其与肿瘤免疫细胞浸润的相关性。方法从癌症基因组图谱数据库检索FASN与cc RCC相关的表达谱数据,通过UALCAN数据库分析cc RCC中FASN基因表达水平及其与cc RCC患者临床病理分期、分级的相关性,使用基因表达谱动态分析网站分析FASN基因与cc RCC患者预后的相关性,使用人蛋白图谱数据库分析人组织中FASN蛋白表达水平,使用肿瘤免疫评估数据库和肿瘤微环境数据库分析FASN与肿瘤免疫的相关性,使用基因注释和分析数据库对FASN及相关基因进行功能富集分析。结果在不同病理分期、分级cc RCC中FASN基因表达水平均显著高于正常组织,FASN基因高表达的患者预后较差。FASN蛋白S207和S2198位点磷酸化水平在cc RCC中显著降低。FASN表达与cc RCC中CD8^(+)T免疫细胞浸润水平呈负相关,与调节性T细胞浸润水平呈正相关,免疫治疗会影响FASN与免疫细胞在cc RCC中共定位。FASN主要参与细胞脂质代谢、甾醇调节元件结合转录因子1激活基因表达、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路、脂肪酸生物合成等生物功能。结论FASN在cc RCC中高表达,且与cc RCC患者临床预后、肿瘤免疫细胞浸润相关。

主 题 词：脂肪酸合酶 肾透明细胞癌 预后分析 生物信息学 免疫浸润 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100214[100214] 10[医学] 

D　O　I：10.3870/j.issn.1674-4624.2023.04.002

馆 藏 号：203123366...