细粒棘球蚴TSP1和TSP6基因的克隆及生物信息学分析

作     者：刘田莉 孟庆玲 乔军 陈诚 马玉 胡政香 才学鹏 陈创夫 LIU Tian-li;MENG Qing-ling;QIAO Jun;CHEN Cheng;MA Yu;HU Zheng-xiang;CAI Xue-peng;CHEN Chuang-fu

作者机构：石河子大学动物科技学院新疆石河子832003 中国农业科学院兰州兽医研究所甘肃兰州730046 

基　　金：国家公益性(农业)行业专项(201303037) 国家国际科技合作项目(2014DFR31310) 新疆自治区研究生科研创新项目(No.XJGRI2014059) 

出 版 物：《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)

年 卷 期：2015年第30卷第2期

页      码：41-46页

摘      要：为了研究绵羊细粒棘球蚴重要抗原基因Tetraspanin 1-TSP1(TSP1)和Tetraspanin 1-TSP6(TSP6)的功能,对Gen Bank中Eg基因组数据库检索,获得TSP1和TSP6的c DNA序列并设计特异性引物。以Eg头节为总RNA模板,进行RT-PCR,将PCR产物克隆到p MD19-T载体后测序并进行生物信息学分析。TSP1 c DNA全长792个核苷酸,编码263个氨基酸,该多肽含有3个潜在的N端糖基化位点,2个N端酰基化位点,与已登录的标准株TSP1基因序列(EG_11043)同源性为98.99%,其推导的氨基酸序列同源性为98.48%;TSP6 c DNA全长666个核苷酸,编码221个氨基酸,该多肽含有5个N端酰基化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点,与已登录的标准株TSP6基因序列(EG_00715)同源性为98.18%,其推导的氨基酸序列同源性为85.07%。运用分子生物学软件对Eg TSP1和TSP6基因进行生物信息学分析,预测已知序列的蛋白质抗原的结构和表位,为疫苗的研发奠定了前期基础。

主 题 词：细粒棘球蚴 抗原基因 基因克隆 生物信息学分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.7668/hbnxb.2015.02.008

馆 藏 号：203124321...