2013—2022年云南地区猪肠病毒G型的分子流行病学调查

作     者：王位 朱沛 李占鸿 薛晓岩 杨钦鸿 李雪 李素华 姚俊 WANG Wei;ZHU Pei;LI Zhanhong;XUE Xiaoyan;YANG Qinhong;LI Xue;LI Suhua;YAO Jun

作者机构：西南林业大学生命科学学院昆明650224 云南畜牧兽医科学院云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室昆明650224 云南农业大学动物医学院昆明650500 

基　　金：云南省农业重大科技专项计划“云南省猪重要疫病防控技术体系构建及应用”(202102AE090007) 云南省财政专项-畜禽种质创新及标准化养殖技术推广课题“牛结节性皮肤病防控技术研究与示范”(云财农【2022】5号) 乡村振兴科技专项-科技特派团(202304BI090003) 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2023年第50卷第12期

页      码：5000-5012页

摘      要：【目的】了解肠病毒G型(Enterovirus G,EV-G)在云南地区猪场中的流行状况及其分子特征,为云南地区EV-G的防控提供理论依据。【方法】根据EV-G的5′-非翻译区(UTR)保守区域设计引物,RT-PCR扩增监测2013-2022年云南地区猪临床腹泻样品的EV-G阳性率,从阳性样品来源的区域、猪群结构及类型分析EV-G在云南地区的感染情况。利用EV-G VP 1基因巢式PCR引物,通过RT-PCR扩增EV-G VP 1基因全序列;采用MegAlign软件分析EV-G云南株的VP1序列与EV-G的20个基因型标准株的相似性及关键氨基酸突变,采用Mega 7.0软件构建VP 1基因的遗传进化树,并通过Protean软件的Jameson-Wolf分析法对VP1蛋白进行抗原指数分析。【结果】云南地区2013-2022年收集的1941份临床样品EV-G总阳性率为19.42%(377/1941),其中大理(54.54%)、玉溪(45.45%)、红河(43.24%)猪群的EV-G感染阳性率明显高于云南其他地区;乳猪(25.19%)和保育猪(24.68%)2个年龄组的猪群阳性感染率高于其他猪群;肛拭子阳性样品的检出率(53.58%)高于肠道内容物(29.71%)及粪便(16.71%)样品。基于20株EV-G代表株VP 1基因序列相似性分析及遗传进化表明,17个云南株为EV-G1型,2株为EV-G6型,1株为EV-G17型。17个EV-G1基因型云南分离株VP1蛋白在第125-150、170-190位氨基酸处抗原指数活跃度显著增强,此区域同时存在多个亲水性氨基酸位点的突变,如P^(127) S、P^(143) S、G^( 146) R、P^( 188 )S。【结论】EV-G1、EV-G6和EV-G17等多种基因型在云南地区猪群中流行,以EV-G1型流行为主。EV-G1基因型云南分离株的VP1蛋白在第125-150、170-190位氨基酸处存在显著的抗原活跃度,可能介导EV-G1基因型毒株在云南的感染和流行。

主 题 词：肠病毒G型(EV-G) VP1 分子流行病学 基因特征 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.16431/j.cnki.1671-7236.2023.12.022

馆 藏 号：203124535...