基于弹性和复杂网络模型的内向整流型钾通道Kir3.2的动力学及关键位点研究

作     者：赵迎春 李春华 

作者机构：北京工业大学环境与生命学部北京 

出 版 物：《生物物理学》 (Biophysics)

年 卷 期：2023年第11卷第4期

页      码：65-72页

摘      要：内向整流型钾通道蛋白Kir3.2能够调节钾离子的跨膜流动,具有重要的生理功能。由于其与神经和心肌系统的疾病相关,因此是一个重要的药物靶点。为研究该通道的动力学和功能性关键位点,我们首先利用高斯网络模型(GNM)对该通道进行建模,分析其结构的柔性,及各功能区域间的运动相关性;然后,构建运动相关性加权的复杂网络模型,通过依次敲除节点获得网络特征路径长度的变化来识别关键位点。结果发现,GNM重现了通道各区域的柔性;界面螺旋、跨膜螺旋和CTD区域间存在显著的运动正相关,这促进了通道与配体的结合和结构的稳定;所识别的关键残基对通道的激活、结构的稳定和变构信号交流起重要作用。本工作有助于加强对Kir3.2通道工作机制的理解,所识别的功能位点可为药物设计提供有价值的信息。

主 题 词：内向整流型钾通道Kir3.2 高斯网络模型 复杂网络模型 关键残基 

学科分类：08[工学] 0812[工学-测绘类] 

D　O　I：10.12677/BIPHY.2023.114006

馆 藏 号：203124585...