生殖道病原菌LAMP检测的环引物设计与优化

作     者：贾义国 徐小芳 陈尚贤 王新博 余跃 孙群 JIA Yiguo;XU Xiaofang;CHEN Shangxian;WANG Xinbo;YU Yue;SUN Qun

作者机构：四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川成都610064 四川大学生命科学学院四川成都610064 

基　　金：国家重点研发计划(2021YFH0060) 四川省重点项目(22QYCX0027) 

出 版 物：《中国测试》 (China Measurement & Test)

年 卷 期：2023年第49卷第11期

页      码：60-67页

摘      要：孕期生殖道病原菌感染是威胁妇女和胎儿健康的常见疾病之一,为改进现有检测方法耗时长的缺陷,对基于环介导等温扩增(loop mediated isothermal amplification,LAMP)的生殖道病原菌快速检测方法进行优化。在Gardnerella vaginalis的LAMP检测体系中,通过对不同环引物组扩增速率(Ct值)进行统计学分析,验证了环引物在LAMP反应中提升扩增速率的能力,同时探究了环引物长度和GC含量对扩增速率的影响,并将其作为环引物筛选参数应用于3种生殖道病原菌(***、Streptococcus agalactiae、Enterococcus faecalis)检测的环引物设计。结果表明,不同GC含量的环引物扩增速率差异不显著,而环引物的长度是影响其扩增效果的关键因素,碱基数较少的环引物有利于提高LAMP反应速率(p<0.05),设计出的引物组GV-1、GBS-132和EF-3可以在105 CFU/mL扩增浓度下在30 min内呈现完整“S”扩增曲线,具有较好的临床病原菌筛查应用潜力。

主 题 词：病原菌检测 环引物 环介导等温扩增 生殖道感染 快速检测 

学科分类：08[工学] 1010[医学-医学技术类] 080402[080402] 0804[工学-材料学] 10[医学] 

D　O　I：10.11857/j.issn.1674-5124.2022050199

馆 藏 号：203124952...