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番茄褐色皱果病毒Taq Man荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用

番茄褐色皱果病毒Taq Man荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用

作     者:李献锋 于璇 冯黎霞 于翠 丁钿 徐强 赵菊鹏 马骏 武目涛 魏霜 LI Xianfeng;YU Xuan;FENG Lixia;YU Cui;DING Tian;XU Qiang;ZHAO Jupeng;MA Jun;WU Mutao;WEI Shuang

作者机构:广州海关技术中心广州510623 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心上海200135 广州白云机场海关综合技术服务中心广州510470 

基  金:国家重点研发计划(2021YFD1400100) 海关总署科研项目(2021HK165,2021HK166) 

出 版 物:《植物保护》 (Plant Protection)

年 卷 期:2023年第49卷第6期

页      码:185-193页

摘      要:为建立番茄褐色皱果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)Taq Man荧光定量RT-PCR方法,本研究针对ToBRFV RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRP)基因序列设计了4组特异性引物和Taq Man探针,构建了标准曲线,并对该方法的特异性、灵敏度和实际样品的检测效率进行评估。结果显示,该方法特异性强,与番茄花叶病毒、番茄斑驳花叶病毒、烟草花叶病毒、黄瓜绿斑驳花叶病毒、番茄环斑病毒、番茄黑环病毒、辣椒轻斑驳病毒、烟草环斑病毒和凤果花叶病毒等9种病毒均无交叉反应。建立的标准曲线的R^(2)为0.999,扩增效率为102.096%,检测灵敏度为10 fg/μL,与EPPO PM 7/146(1)推荐的CaTa28、CSP1325方法相当,是常规RT-PCR的100倍;采用该方法成功从60份番茄和辣椒叶片、种子样品中检出10份阳性样品。建立的Taq Man荧光定量RT-PCR方法特异性强、灵敏度高,适用于实际样品中ToBRFV的快速精准检测。

主 题 词:番茄褐色皱果病毒 RNA依赖的RNA聚合酶 Taq Man探针 荧光定量RT-PCR 检测 

学科分类:09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

核心收录:

D O I:10.16688/j.zwbh.2022531

馆 藏 号:203125147...

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