分子动力学模拟研究二硫键对抗菌肽MDP-2结构的影响

作     者：刘岳敏 王敬祺 廖智 何梦岚 严小军 LIU Yuemin;WANG Jingqi;LIAO Zhi

作者机构：浙江海洋大学海洋科学与技术学院浙江舟山316022 浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心浙江舟山316022 

基　　金：浙江省教育厅一般科研项目(Y202044838) 

出 版 物：《浙江海洋大学学报（自然科学版）》 (Journal of Zhejiang Ocean University：Natural Science)

年 卷 期：2023年第42卷第6期

页      码：471-475页

摘      要：人工设计合成的抗菌肽MDP-2含有4个半胱氨酸残基形成2对二硫键,其具有较高的抑菌活性。为了研究2对二硫键结构是否为MDP-2发挥抑菌活性所必须,采用分子动力学模拟对含Cys1-Cys10与Cys3-Cys8间2对二硫键的抗菌肽MDP-2、含有Cys1-Cys10间二硫键的MDP-2.1与含有Cys3-Cys8间二硫键的MDP-2.2、不含二硫键的MDP-2.3进行模拟,分析含不同二硫键数目情况下MDP-2的结构稳定性。研究结果表明含有Cys1-Cys10残基间二硫键的MDP-2.1具有更为稳定的二级结构和更大溶液可及性表面积。因此,Cys1-Cys10残基间的二硫键对抗菌肽MDP-2保持?茁-发夹二级结构具有重要作用,Cys3-Cys8残基间的二硫键没有明显作用。

主 题 词：分子动力学模拟 抗菌肽 二硫键 

学科分类：081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 070303[070303] 0703[理学-化学类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1008-830X.2023.06.001

馆 藏 号：203125624...