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南方水稻黑条矮缩病毒江西分离物CP基因克隆及序列分析

南方水稻黑条矮缩病毒江西分离物CP基因克隆及序列分析

作     者:孙晓棠 崔汝强 欧阳林娟 胡丽芳 傅军如 贺晓鹏 边建民 贺浩华 朱昌兰 

作者机构:江西农业大学农学院/作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室江西南昌330045 

基  金:国家"十二五"科技支撑计划课题(2012BAD14B1) 江西省重大科技专项计划(20114ABF03102) 高等学校博士学科点专项科研基金(20113603110001) 国家转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08001-002) 

出 版 物:《江西农业大学学报》 (Acta Agriculturae Universitatis Jiangxiensis)

年 卷 期:2013年第35卷第5期

页      码:901-905页

摘      要:根据GenBank已登陆的SRBSDV S10核苷酸序列设计引物,克隆SRBSDV江西分离物外壳蛋白(CP)基因,结合已公布的序列,通过生物信息学方法进行序列分析。结果表明,SRBSDV江西分离物CP基因全长1 674个核苷酸,推测编码557个氨基酸,与已报道的SRBSDV CP基因之间核苷酸同源性为97.5%~100%,氨基酸同源性为97.7%~100%。SRBSDV CP基因核苷酸序列高度保守,保守位点占全部位点的83.5%。没有发现重组事件。本研究首次报道根据系统发育进化树,SRBSDV可分为2大组群,不存在明显的地域和寄主分化。

主 题 词:南方水稻黑条矮缩病毒 CP基因 基因克隆 序列分析 

学科分类:09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

D O I:10.3969/j.issn.1000-2286.2013.05.001

馆 藏 号:203125645...

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