陕西地区荷斯坦牛Mx1基因外显子多态性分析

作     者：王风巧 党瑞华 黄洁萍 雷初朝 蓝贤勇 陈宏 WANG Feng-qiao;DANG Rui-hua;HUANG Jie-ping;LEI Chu-zhao;LAN Xian-yong;CHEN Hong

作者机构：西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌712100 

基　　金：国家自然科学基金项目(81270439) 校基本科研创新一般项目(Z109021204) 引进人才科研启动费(Z111021202) 

出 版 物：《家畜生态学报》 (Journal of Domestic Animal Ecology)

年 卷 期：2014年第35卷第5期

页      码：13-17,46页

摘      要：牛Mx1基因位于1号染色体上,含有14个外显子,编码648个氨基酸。研究以346头陕西地区荷斯坦牛为研究对象,根据GenBank所提供的牛Mx1基因序列,设计15对引物,采用混合DNA池扩增测序和PCR-RFLP的方法对牛Mx1基因的14个外显子进行多态性分析。结果表明,4个SNPs,分别位于外显子3(g.843330T>C,g.843411A>G)、外显子4(g.844048C>T)和外显子7(g.851325T>C)。其中,外显子4(g.844048C>T)为同义突变;外显子3(g.843330T>C,g.843411A>G)两个位点的突变分别导致了异亮氨酸(Ile)向苏氨酸(Thr)、谷氨酸(Glu)向精氨酸(Arg)的突变;外显子7(g.851325T>C)位点的突变导致亮氨酸(Leu)变为脯氨酸(Pro)。4个SNPs位点都存在三种基因型,但纯合子的突变频率较低。4个SNPs位点共构建了11种单倍型,其中以H6为最主要的单倍型。结果显示,陕西地区荷斯坦牛Mx1基因存在较丰富的多态性,这将为Mx1基因结构和功能的研究以及将来在育种实践中的应用提供基础资料。

主 题 词：荷斯坦牛 Mx1基因 SNP 外显子 PCR-RFLP 

学科分类：0905[农学-林学类] 09[农学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1673-1182.2014.05.003

馆 藏 号：203125832...