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猪T细胞受体β链的基因结构及其多样性分析

猪T细胞受体β链的基因结构及其多样性分析

作     者:曾爽 李玩生 房永祥 冯海燕 陈国华 何小兵 贾怀杰 景志忠 

作者机构:中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室 农业部兽医公共卫生重点实验室兰州730046 

基  金:国家自然科学基金项目(31372423) 甘肃省技术研究与开发专项(1207TCYA025) 

出 版 物:《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期:2014年第45卷第11期

页      码:1874-1882页

摘      要:设计猪TCRβ链基因的一对特异性引物,用RT-PCR法从合作小型猪外周血、淋巴结和脾淋巴细胞中高通量克隆和鉴定了82个猪TCRβ基因(简称STB)。测序分析表明,克隆的猪TCRβ链的基因都含有可变的信号肽区和V区、高变的D区和J区以及恒定的C区的基因片段,绝大部分基因间的核苷酸序列组成都不完全相同,且具有十分复杂的多态性和多样性,基因间的相似性在36.6%~99.9%,这与TCRβ链的基本基因结构特征相一致。猪TCRβ基因的分子结构、遗传演化关系和归类分析发现,在同一类基因分子中其信号肽区、FR1区和CDR1区、FR2区和CDR2区以及FR3区之间的差异主要由V基因片段的多态性引起,而CDR3区的差异主要由其D、J基因片段的多样性造成。同时发现猪TCRβ与人类的遗传演化关系较近,大部分基因序列都能找到与人类对应的TRBV、TRBD、TRBJ基因片段,但又存在一定的差异性。这表明,猪TCRβ基因既有应对外界复杂微生物环境的免疫多样性分子遗传基础,也有物种间的相似性与特异性。

主 题 词:合作小型猪 TCRβ基因 生物信息学 多样性 

学科分类:090602[090602] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录:

D O I:10.11843/j.issn.0366-6964.2014.11.019

馆 藏 号:203125946...

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