几种改进的CoMFA方法比较研究血小板活化因子拮抗剂

作     者：聂晶 董喜成 潘家祜 Nie Jing;Dong Xicheng;Pan Jiahu

作者机构：复旦大学药学院上海200032 中国科学院上海有机化学研究所计算机化学重点实验室上海200032 

基　　金：科技部国家重点基础发展规划973项目(No.G1998051115) 

出 版 物：《化学学报》 (Acta Chimica Sinica)

年 卷 期：2003年第61卷第7期

页      码：1129-1135页

摘      要：由于传统的比较分子场分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷,使得分子的叠合规则以及叠合分子的空间取向和空间位置等因素对q^2的影响很大,因此相继提出了几种改进的CoMFA方法.为了优化CoMFA结果,应用传统的CoMFA方法和交叉验证的R^2引导的区域选择法(q^2-GRS)、全取向搜索法(AOS)、全空间搜索法(APS)以及比较分子相似性指数(CoMSIA)等四种改进的CoMFA方法,对18个pinusolide类衍生物这类新发现的血小板活化因子(PAF)拮抗剂进行了比较研究.结果表明四种改进的CoMFA方法得到的q^2值均比传统CoMFA的高.q^2-GRS方法得到的q^2值有所提高,但综合结果并不理想,AOS与APS得到的q^2较为理想,而在CoMSIA中,q^2几乎不受空间取向或空间位置的影响.同时我们引入基于样本的偏最小二乘法(SAMPLS)取代原AOS/APS程序中的传统PLS进行统计分析,明显提高了其运行速度.最后,根据q^2最高的CoMFA模型和CoMSIA模型设计了几个预测活性更高的pinusolide类似物.

主 题 词：CoMFA方法 血小板活化因子拮抗剂 比较分子场分析 R^2引导的区域选择法 全取向搜索法 全空间搜索法 配体药物 药物设计 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:0567-7351.2003.07.029

馆 藏 号：203126356...