CODEHOP法设计引物克隆色盐杆菌ST307胆碱脱氢酶基因及其序列分析

作     者：何冬华 齐文静 纪婧琦 戴美学 夏志洁 HE Dong-hua;QI Wen-jing;JI Jing-qi;DAI Mei-xue;XIA Zhi-jie

作者机构：山东师范大学生命科学学院山东济南250014 

出 版 物：《食品与药品》 (Food and Drug)

年 卷 期：2012年第14卷第1期

页      码：12-15页

摘      要：目的研究色盐杆菌ST307甜菜碱的合成,克隆分析其胆碱脱氢酶betA基因片段。方法采用醇提法提取色盐杆菌ST307中的甜菜碱并检测,用CODEHOP在线程序设计简并引物扩增胆碱脱氢酶betA基因序列,并进行序列分析。结果色盐杆菌ST307细胞中积累甜菜碱,通过PCR获得长度为485 bp的betA基因片段。BLAST序列分析显示该基因序列与多个菌株的betA基因序列具有较高的同源性,最高达83%。核苷酸序列比对及进化树构建结果显示,色盐杆菌ST307胆碱脱氢酶基因序列与Pseudomonas fulva 12-X进化关系最为接近。结论 CODEHOP法设计的简并引物可信性较强,同时betA基因片段的成功克隆将为获得ST307胆碱脱氢酶基因的全序列、研究耐盐机制和遗传改良提供科学依据。

主 题 词：CODEHOP 简并引物 betA基因 克隆 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 090601[090601] 071010[071010] 07[理学] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1672-979X.2012.01.004

馆 藏 号：203126445...