HIV-1整合酶四聚体结构模拟及其活性位点分析

作     者：吴可柱 李爱秀 缪有盼 刘涛 马翼 

作者机构：中国人民武装警察部队医学院基础医学部药物设计实验室天津300162 中国人民武装警察部队医学院职业与环境危害生物标志物天津市重点实验室天津300162 南开大学元素有机化学国家重点实验室天津300071 

基　　金：国家自然科学基金(No.30472166) 天津市科技攻关计划重点科技攻关专项基金(No.06YFGZSH07000) 

出 版 物：《中国生物化学与分子生物学报》 (Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology)

年 卷 期：2009年第25卷第6期

页      码：549-555页

摘      要：HIV-1复制需要HIV-1整合酶将其环状DNA整合进宿主DNA中,这其中包括2个重要反应,即"3′-加工"和"链转移",两者均由HIV-1整合酶催化完成.阻断其中的任一反应,都能达到抑制HIV-1复制的目的.因此,了解HIV-1整合酶的完整结构和聚合状态,对深入探讨其作用机理及设计新型抑制剂具有重要的指导作用.然而,迄今为止仅有HIV-1整合酶单独结构域的晶体结构可供参考,而其全酶晶体结构尚未获得解析.本研究利用分子模拟技术,通过蛋白质-蛋白质/DNA分子对接、动力学模拟等方法,构建了全长整合酶四聚体的结构模型、HIV-1DNA与整合酶复合物的结构模型,进一步从理论上证实HIV-1整合酶是以四聚体形态发挥催化作用,明确"3′-加工"和"链转移"在HIV-1整合酶上的催化位点.同时,通过与作用机理相似的细菌转座子Tn5转座酶等的结构比对,推测HIV-1整合酶的核心结构域中应有第2个Mg2+存在,其位置螯合于Asp64与Glu152之间.在HIV-1整合酶结构研究的基础上,有望进一步设计出新的抗艾滋病药物.

主 题 词：HIV-1整合酶 四聚体结构 分子对接 动力学模拟 活性位点 

学科分类：1007[医学-药学类] 100701[100701] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.13865/j.cnki.cjbmb.2009.06.010

馆 藏 号：203126454...