正交设计优化崇明白山羊SSR-PCR反应体系

作     者：罗倩倩 张小平 刘志学 成建忠 黄松明 陈士超 

作者机构：安徽师范大学生命科学学院安徽芜湖241000 同济大学生命科学与技术学院上海200092 上海市崇明县动物疫病预防控制中心上海202100 

基　　金：上海市生态崇明重大科技攻关专项(07DZ19063) 国家"863"计划重点项目(2008AA101001) 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2010年第46卷第15期

页      码：12-15页

摘      要：以崇明白山羊基因组DNA为模板,利用正交试验设计L16(45),对影响崇明白山羊SSR-PCR反应体系的5个因素(Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP及引物的浓度)进行优化。结合单因素完全随机试验筛选各因素的最佳水平,针对MCB3224引物建立了崇明白山羊SSR-PCR的最佳反应体系。结果表明:在20μL的反应体系中,5个因素的最佳水平分别为Taq DNA聚合酶0.5 U、Mg2+2.5 mmol/L、模板DNA 30 ng、dNTP 0.20 mmol/L,引物0.8 mol/L;引物的最佳退火温度为57.3℃。利用16份崇明白山羊的DNA模板和2个微卫星引物验证此反应体系,聚丙烯酰胺凝胶电泳,结果显示该体系稳定可靠且普适性较好。

主 题 词：SSR-PCR 正交设计 体系优化 山羊 

学科分类：0905[农学-林学类] 09[农学] 090501[090501] 

馆 藏 号：203126553...