北京黑猪LPL和NUDT3基因多态性及其与肉质性状的关联分析

作     者：苏艳芳 牛乃琪 宗文成 刘先策 刘海 石国华 井西涛 张龙超 SU Yanfang;NIU Naiqi;ZONG Wencheng;LIU Xiance;LIU Hai;SHI Guohua;JING Xitao;ZHANG Longchao

作者机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 北京黑六牧业科技有限公司北京102211 

基　　金：国家重点研发计划项目(2021YFD1301101) 国家生猪产业技术体系(CARS-35) 中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS02) 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2024年第51卷第3期

页      码：1111-1121页

摘      要：【目的】研究脂蛋白脂酶(lipoprteinlipase,LPL)和Nudix水解酶3(Nudix hydrolase homolog 3,NUDT3)基因多态性与北京黑猪肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量和背膘厚的关联性,从而在分子水平上指导北京黑猪的育种工作。【方法】利用347头北京黑猪背最长肌样本进行IMF含量和背膘厚数据测定,按照IMF含量进行高、低分组。根据猪NUDT3和LPL基因序列设计引物并进行PCR扩增及测序,运用DNAStar软件中SeqMan分析测序结果,使用Duncan’s多重检验对2个基因不同基因型与北京黑猪IMF含量和背膘厚进行关联分析,并运用实时荧光定量PCR对其进行基因表达差异分析。【结果】LPL基因存在1个错义突变、3个同义突变和3个3′-UTR突变;NUDT3基因存在6个3′-UTR突变。LPL基因CDS区c.431 G>C位点与北京黑猪第6~7肋背膘厚显著相关,c.647 G>C位点与胸腰结合处背膘厚显著相关,c.637 A>G位点与第6~7肋背膘厚、胸腰结合处背膘厚和腰荐结合处背膘厚均显著相关(PG位点与胸腰结合处背膘厚显著相关,c.1689 C>A位点与IMF含量显著相关(PT位点与北京黑猪IMF含量和腰荐结合处背膘厚显著相关,c.6068 C>G位点与IMF含量和第6~7肋背膘厚显著相关,c.5729 G>A位点与IMF含量显著相关(PT位点IMF含量高、低组间表达量无显著差异,LPL基因c.1689 C>A位点CC与AA基因型间表达量无显著差异(P>0.05)。【结论】北京黑猪群体中LPL和NUDT3基因的突变位点与IMF含量显著关联,为北京黑猪肉品质选育提供了新的分子标记。

主 题 词：北京黑猪 NUDT3基因 LPL基因 肉品质 关联分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 0905[农学-林学类] 09[农学] 071007[071007] 0836[0836] 090501[090501] 

D　O　I：10.16431/j.cnki.1671-7236.2024.03.023

馆 藏 号：203126649...