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肺癌患者外周血和胸腔积液T细胞受体组库特征分析

肺癌患者外周血和胸腔积液T细胞受体组库特征分析

作     者:宋娟 王林林 胡洁 宋元林 童琳 SONG Juan;WANG Linlin;HU Jie;SONG Yuanlin;TONG Lin

作者机构:复旦大学附属中山医院呼吸与危重症医学科上海200032 上海市重大传染病与生物安全研究院上海200032 

基  金:国家自然科学基金(82170088) 上海市临床重点专科建设项目(shslczdzk02201) 上海市科学技术委员会上海市肺部炎症与损伤重点实验室项目(20DZ2261200) 上海市科学技术委员会上海工程技术研究中心建设计划(20DZ2254400) 

出 版 物:《中国临床医学》 (Chinese Journal of Clinical Medicine)

年 卷 期:2024年第31卷第1期

页      码:60-67页

摘      要:目的 比较肺癌患者外周血和胸腔积液的T细胞受体(TCR)组库的免疫学特征。方法 收集2020年7月至2021年1月在复旦大学附属中山医院就诊的5例合并恶性胸腔积液肺癌患者的外周血和胸腔积液,分离外周血单个核细胞(PBMC)和胸腔积液单个核细胞(PEMC),提取基因组DNA,采用Illumina MiSeq平台对TCR进行高通量测序,分析TCR组库的多样性等特征。结果 PBMC和PEMC中的TCR克隆型、VJ pairs和互补决定区3(CDR3)序列的多样性和相关性差异均无统计学意义。PBMC中检测到的TCR克隆数量高于PEMC(P<0.05),VJ pairs和CDR3数量与PEMC差异无统计学意义。PBMC和PEMC配对样本的共有VJ pairs数量占总VJ pairs的比例高于共有克隆型和CDR3序列的数量比例(P<0.05),后两者差异无统计学意义。PEMC中高扩增克隆(HEC)数量和占比均高于PBMC。同时鉴定了36个在PBMC和PEMC中差异表达的VJ pairs,其中25个在PEMC中表达升高、9个在PEMC中表达降低。结论 肺癌患者外周血和胸腔积液的TCR组库表现出不同的特征性变化,可能为肺癌重要的免疫病理学特征。

主 题 词:肺癌 恶性胸腔积液 T细胞受体组库 外周血单个核细胞 胸腔积液单个核细胞 多样性 

学科分类:1002[医学-临床医学类] 100214[100214] 10[医学] 

D O I:10.12025/j.issn.1008-6358.2024.20231869

馆 藏 号:203126659...

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