燕麦EST-SSR标记的开发和利用

作     者：郭红媛 贾举庆 张仙红 剌士潇 杨武德 GUO Hong-Yuan;JIA Ju-Qing;ZHANG Xian-Hong;LA Shi-Xiao;YANG Wu-De

作者机构：山西农业大学农学院山西太谷030801 山西农业大学旱作工程研究所山西太谷030801 

基　　金：国家自然科学基金(31101199) 山西省基础研究计划项目(2012021024-2) 山西农业大学"中青年学术带头人及学术骨干"项目(XG201209) 山西农业大学引进人才科研启动项目(XB2010009) 

出 版 物：《植物科学学报》 (Plant Science Journal)

年 卷 期：2014年第32卷第3期

页      码：240-250页

摘      要：为拓展分子标记在燕麦种质资源分析与鉴定中的应用,利用公共数据库中的25376条EST(expressed sequence tags)序列,开展了燕麦EST-SSR功能性标记的开发和利用研究。25376条EST序列经拼接去冗余后获得了11618条序列,从中筛选出含有不同重复基元的SSR且重复次数较多、长度较长的556条EST序列进行引物设计,开发了50对燕麦EST-SSR引物,通过筛选得到40对有效的EST-SSR引物。选取其中4对引物对5个燕麦种质资源进行了PCR扩增及产物测序,结果表明扩增条带多态性是由SSR差异造成的。利用40对ESTSSR引物对15个六倍体燕麦种质资源进行遗传多样性分析,共扩增出89个等位基因,平均每对引物产生2.23个等位基因;UPGMA聚类分析表明,15个六倍体燕麦种质资源在Dice系数为0.93处聚为3支,基本上是按照不同种进行聚类的,在相同种中又根据地理来源分别聚集成支。利用40对EST-SSR引物对31个遗传背景不清的燕麦种质资源进行基因组倍性鉴定,发现这些种质中可能存在有四倍体和二倍体的燕麦新资源。本研究开发的燕麦EST-SSR功能性标记将在燕麦遗传多样性分析、遗传图谱构建及燕麦属内种间基因组鉴定等方面发挥重要作用。

主 题 词：燕麦属 EST—SSRs 引物开发 多态性 

学科分类：07[理学] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 0713[0713] 

核心收录：

D　O　I：10.3724/SP.J.1142.2014.30240

馆 藏 号：203126721...