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一种面向生物基因组可变剪接问题的网络并行求解方案

一种面向生物基因组可变剪接问题的网络并行求解方案

作     者:徐国市 鲁发凯 许卓群 余华山 丁文魁 Xu Guoshi;Lu Fakai;Xu Zhuoqun;Yu Huashan;Ding Wenkui

作者机构:北京大学信息科学技术学院北京100871 

基  金:国家"八六三"高技术研究发展计划基金项目(2006AA02Z334) 国家自然科学基金重大项目(90412010) 国家自然科学基金面上项目(60303001) 国家科技基础条件平台建设基金项目(2005DKA64001) 

出 版 物:《计算机研究与发展》 (Journal of Computer Research and Development)

年 卷 期:2007年第44卷第10期

页      码:1682-1687页

摘      要:生物基因的可变剪接是调节基因表达和产生蛋白质组多样性的重要机制,具有重要的生物学意义.随着生物数据的快速增长,单机计算环境难以满足可变剪接研究所需要的超大计算能力.为了解决这一问题,提出了一种面向生物基因组可变剪接问题的网络并行求解方案.它充分考虑了可变剪接问题的挑战,设计了面向服务的网络资源虚拟化方案,提供了对网络资源一致的选择、访问、监控接口.通过一组API提供了面向用户的应用层支持,屏蔽了访问网络资源的细节,支持用户快速有效的开发应用程序.

主 题 词:并行计算 网络计算 可变剪接 资源虚拟化 面向服务的体系结构 

学科分类:0810[工学-土木类] 12[管理学] 1201[管理学-管理科学与工程类] 0808[工学-自动化类] 0839[0839] 08[工学] 0835[0835] 0811[工学-水利类] 081201[081201] 0812[工学-测绘类] 

核心收录:

D O I:10.1360/crad20071008

馆 藏 号:203127067...

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