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澳洲坚果SCoT反应体系的建立及应用

澳洲坚果SCoT反应体系的建立及应用

作     者:蔡元保 杨祥燕 陈显国 曾黎明 郭凌飞 林玉虹 崔明勇 CAI Yuan-bao;YANG Xiang-yan;CHEN Xian-guo;ZENG Li-ming;GUO Ling-fei;LIN Yu-hong;CUI Ming-yong

作者机构:广西亚热带作物研究所南宁530001 厦门市农业机械监理所福建厦门361009 

基  金:广西直属公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(桂热研201102)资助 

出 版 物:《热带亚热带植物学报》 (Journal of Tropical and Subtropical Botany)

年 卷 期:2013年第21卷第3期

页      码:253-258页

摘      要:为建立澳洲坚果(Macadamia spp.)的SCoT最适反应体系,用单因素设计方法对影响SCoT-PCR反应体系的主要影响因素进行了优化筛选,并构建了澳洲坚果种质的指纹图谱。结果表明,澳洲坚果的SCoT最适反应体系为:反应体系总体积为20μL,包含2.5 mmol L–1Mg2+,0.3 mmol L–1dNTPs,0.8μmol L–1引物,40 mg L–1模板DNA和1.0 U Taq DNA聚合酶。最适退火温度为50℃。该反应体系对澳洲坚果种质具有良好的稳定性、可靠性和较高的分辨率。选用多态性良好的单引物SC5和引物组合SC34+SC39,可以将12份澳洲坚果种质完全区分开,每份种质都各有独特的指纹图谱,置信概率达到99.988%。构建的SCoT反应体系可为澳洲坚果种质鉴定和遗传多样性分析等提供技术支持。

主 题 词:澳洲坚果 SCoT 单因素试验 体系优化 DNA指纹图谱 

学科分类:09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1005-3395.2013.03.011

馆 藏 号:203127301...

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