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水牛NOBOX基因启动子克隆及转录活性检测

水牛NOBOX基因启动子克隆及转录活性检测

作     者:陆杏蓉 庞春英 朱鹏 邓廷贤 段安琴 陈明棠 杨炳壮 梁贤威 

作者机构:中国农业科学院广西水牛研究所/广西水牛遗传繁育重点实验室南宁530001 

基  金:农业部转基因重点项目(2014ZX08010-012B) 广西水牛研究所基本科研项目(水牛基1504004) 

出 版 物:《黑龙江畜牧兽医》 (Heilongjiang Animal Science And veterinary Medicine)

年 卷 期:2016年第2期

页      码:196-200,265,266页

摘      要:为了对广西本地水牛新生儿卵巢同源盒基因(NOBOX基因)5 侧翼序列进行克隆、生物信息学分析及其转录活性进行研究,试验采用Gen Bank上已公布的黄牛NOBOX基因5 侧翼序列设计引物,以广西本地水牛血液基因组为模板扩增NOBOX基因5 侧翼序列并进行生物信息学分析。结果表明:研究成功克隆得到广西本地沼泽型水牛NOBOX基因5 侧翼序列及部分CDS区序列,共2 906 bp。同源性分析结果表明,其与地中海水牛、黄牛、绵羊和山羊的相似性分别为99%、96%、91%、91%。试验对NOBOX基因5 侧翼序列2 000 bp进行启动子及转录因子结合位点预测,在其翻译起始位点上游-868/-853 bp处存在TATA box,启动子区存在GATAs、Foxo1、Foxo3、Nobox、Stat1、Stat3、Stat4、Stat5a、Stat5b、Stat6、YY1等反式作用元件结合位点,其中GATAs家族基因在NOBOX启动子区存在多个结合位点,且同一位点又存在多个GATA基因结合。水牛NOBOX启动子能够启动EGFP在HEK-293T细胞上表达,但表达非常微弱,也能够启动EGFP在CHO细胞上表达,且与CMV启动EGFP在CHO细胞中的表达强度相似,表明水牛NOBOX是个强启动子。

主 题 词:水牛 新生儿卵巢同源盒基因(NOBOX基因) 克隆 生物信息学分析 转录活性 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 0905[农学-林学类] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D O I:10.13881/j.cnki.hljxmsy.2016.0242

馆 藏 号:203127422...

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