基于转录组SSR的三角梅遗传多样性分析

作     者：姚国琼 杨帆 严苓方 孙正海 李伟 Yao Guoqiong;Yang Fan;Yan Lingfang;Sun Zhenghai;Li Wei

作者机构：西南林业大学云南省面向南亚东南亚经济林全产业链联合研发中心昆明650224 西南林业大学云南省高效经济林培育示范型国际科技合作基地昆明650224 西南林业大学园林园艺学院昆明650224 云南吉成园林科技股份有限公司弥勒652339 

基　　金：云南省国际合作专项(2019IB011) 云南省重点研发计划项目(2018BB013) 云南省平台建设运行专项(2016YB462) 西南林业大学博士科研启动基金项目(111433)共同资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年第22卷第11期

页      码：3615-3626页

摘      要：为揭示三角梅的遗传背景,本研究采用软件MicroSAtellite搜索其苞片转录组SSR位点,使用Primer Premier 5软件设计50对SSR引物,将筛选出的多态性引物用于55份三角梅材料的聚丙烯酰胺凝胶电泳,采用Popgene 32、PowerMarker V3.25和Structure V2.3.4等软件分析三角梅遗传多样性。结果显示,从50对SSR引物中筛选出25对条带清晰且多态性好的引物,25对SSR引物共检测到76个等位基因,平均每对引物有3个等位基因,平均有效等位基因数为2.30,引物多态性信息量(PIC)在0.01~0.66之间,均值为0.38。55个三角梅材料间的遗传距离为0.01~0.92,平均遗传距离为0.43;在遗传距离0.44处,聚类分析将55份材料分为3个群体。与印度三角梅栽培种比较而言,本实验研究的三角梅材料的遗传多样性水平不高,结果可为三角梅品种鉴定、保护及进化提供一定参考价值。

主 题 词：三角梅 SSR分子标记 遗传多样性 

学科分类：090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

D　O　I：10.13271/j.mpb.022.003615

馆 藏 号：203127496...