淮安市H3N2亚型流感病毒全基因组序列的遗传特征分析

作     者：杨鹏飞 何芳 阴万利 高彤 张旺 魏明月 熊成龙 胡伟 Yang Pengfei;He Fang;Yin Wanli;Gao Tong;Zhang Wang;Wei Mingyue;Xiong Chenglong;Hu Wei

作者机构：淮安市疾病预防控制中心淮安223002 淮安市突发公共卫生事件应急检测重点实验室淮安223002 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室、公共卫生安全教育部重点实验室上海200433 

基　　金：淮安市创新服务能力建设计划(重点实验室建设)(HAP201906) 淮安市科技局指导性项目(HABZ202306) 江苏省第五期"333工程"科研项目 

出 版 物：《中华实验和临床病毒学杂志》 (Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology)

年 卷 期：2024年第38卷第2期

页      码：156-161页

摘      要：目的了解江苏省淮安市H3N2亚型流感病毒的生物学特性和变异情况,为流感疫情防控与疫苗研发提供参考依据。方法选取4株2022年淮安市流感监测网络实验室分离的流感毒株,通过全基因组核酸提取、文库构建,应用Nanopore三代测序平台对H3N2亚型毒株进行全基因组序列测定,利用生物信息学软件比对基因组序列相似性、构建系统发育树,解析氨基酸变异特征。结果8个基因节段之间的核苷酸相似性为97.1%~100.0%,相似性差异最大的是HA基因(97.1%~99.9%),差异最小的是MP基因(98.6%~99.9%)。核苷酸位点变异频率最高和最低的节段分别是HA基因(3.06%)和MP基因(1.43%),不同基因节段核苷酸变异率有统计学意义(χ^(2)=14.293,P=0.046)。HA和NA基因发育树拓扑结构基本一致,3株隶属3C.2a1b.2a.1a进化簇,1株独立属于3C.2a1b.1b进化分支且糖基化位点相较于另外3株在HA1蛋白142NWT、149NGT和NA蛋白436NLS位点发生丢失。4株淮安株均对NA抑制剂和金刚烷胺类药物敏感。结论1株淮安株抗原性发生了改变,与当年疫苗株匹配性较低,建议持续加强H3N2流感病毒的基因监测,为流感防控及流感疫苗筛选提供科学依据。

主 题 词：流感病毒 H3N2 全基因组分析 遗传进化 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D　O　I：10.3760/cma.j.cn112866-20231221-00076

馆 藏 号：203127589...