双瓶选择饮酒致酒精依赖小鼠海马中长链非编码RNA的表达谱分析

作     者：薛琳媛 武南南 封芮芮 赵欣 张宇 殷丽天 XUE Linyuan;WU Nannan;FENG Ruirui;ZHAO Xin;ZHANG Yu;YIN Litian

作者机构：山西医科大学基础医学院生理学系、细胞生理学教育部重点实验室山西太原030001 

基　　金：国家自然科学基金(81601167) 山西省回国留学人员科研资助项目(2020-080) 山西省“1331工程”重点学科建设计划(XK201708) 

出 版 物：《中国生物制品学杂志》 (Chinese Journal of Biologicals)

年 卷 期：2024年第37卷第5期

页      码：559-565页

摘      要：目的对双瓶选择饮酒致酒精依赖小鼠海马中的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱进行分析。方法通过双瓶选择饮酒法建立酒精依赖小鼠模型,同时设对照组(饮水)。选取酒精组酒精偏好率>60%且酒精饮用量>10 g/(kg·24 h)的雄性小鼠3只,随机抽取对照组雄性小鼠3只,分离双侧海马脑组织,液氮保存。采用Agilent084388芯片对小鼠海马脑组织RNA样本lncRNA和mRNA进行测序分析,lncRNA表达谱芯片(ncRNA microarray)检测样本中lncRNA的差异表达情况。基因功能(Gene Ontology,GO)和信号通路数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析差异表达lncRNA可能涉及的生物学过程及参与的信号通路。Pearson相关分析预测与每个差异表达lncRNA共表达的编码基因,超几何分布检验法计算每个对应转录因子条目中差异基因富集的显著性,Cytoscape软件绘制可视化网络图。结果与对照组比较,酒精组小鼠海马组织差异表达的lncRNA共855个(FC≥2.0,P<0.05),337个显著上调,上调幅度最大的为NONMMUT025786.2和NONMMUT072246.2;518个显著下调,下调幅度最大的为NONMMUT113098.1和NONMMUT076455.1。两组小鼠差异表达mRNA共361个(FC≥2.0,P<0.05),271个显著上调,Upf3b和Zfp943上调幅度最大;90个显著下调,Adamts13和Ift27下调幅度最大。差异表达的lncRNA以细胞表面正向调控、GTP酶活性、细胞囊泡运输差异最明显;其主要参与的信号通路有丙酸酯代谢通路、牛磺酸代谢通路、细胞外基质受体和AMPK信号通路。最富集的转录因子为FOXL1和LHX3,分别有25和21个对应共表达基因。结论通过高通量基因表达谱芯片分析,获得了lncRNA和mRNA可能的关键调控位点。本研究为海马脑区酒精依赖相关分子机制的研究提供了实验依据。

主 题 词：长链非编码RNA 酒精依赖 海马 双瓶选择饮酒 基因芯片 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100205[100205] 10[医学] 

D　O　I：10.13200/j.cnki.cjb.003910

馆 藏 号：203127842...