双金属存在下整合酶和抑制剂5CITEP的分子对接研究

作     者：郑喜亮 张红星 孙家锺 ZHENG Xi-Liang;ZHANG Hong-Xing;SUN Chia-Chung

作者机构：吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023 

基　　金：国家自然科学基金(批准号:20173021)资助 

出 版 物：《高等学校化学学报》 (Chemical Journal of Chinese Universities)

年 卷 期：2006年第27卷第7期

页      码：1298-1302页

摘      要：在H IV-1整合酶(IN)和5C ITEP复合物晶体结构的基础上,用分子对接程序(A ffin ity)将含有单Mg2+和双Mg2+的H IV-1 IN核心区与抑制剂5C ITEP进行对接,获得了能形成复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间的相互作用能和结构分析给出此种抑制剂的结合模式,并与晶体结构进行比较,揭示出引入的第二个Mg2+原子在整合过程中所起的重要作用.前后相互作用能的变化趋势很明显,配体和受体的作用模式比单Mg2+体系更加清晰.由单Mg2+体系的4种作用方式改变到双Mg2+体系的两种作用方式,相互作用能提高了将近40 kJ/mol.为基于整合酶结构的药物设计提供了参考信息.

主 题 词：HIV-1整合酶(IN) 分子对接 双金属 

学科分类：081704[081704] 07[理学] 070304[070304] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0703[理学-化学类] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:0251-0790.2006.07.016

馆 藏 号：203127853...