洋葱伯克霍尔德菌群3种检测方法的比较

作     者：李珏 王银环 王庭璋 张林爽 陈欢 李钧 郑小玲 王知坚 LI Jue;WANG Yinhuan;WANG Tingzhang;ZHANG Linshuang;CHEN Huan;LI Jun;ZHENG Xiaoling;WANG Zhijian

作者机构：浙江省食品药品检验研究院国家药品监督管理局药品微生物检测与预警重点实验室药品接触材料质量控制研究重点实验室杭州310052 浙江省微生物技术与生物信息学研究重点实验室杭州310012 杭州微数生物科技有限公司杭州311202 杭州市疾病预防控制中心杭州310021 

基　　金：浙江省药品监管系统科技计划项目(2022035) 浙江省市场监督管理局科技计划项目(20210128) 内蒙古自治区药品监督管理局药品安全监管科研项目(NMYJ-KJ-202303) 

出 版 物：《中国现代应用药学》 (Chinese Journal of Modern Applied Pharmacy)

年 卷 期：2024年第41卷第8期

页      码：1091-1098页

摘      要：目的通过对环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)、基于聚合酶链式扩增(polymerase chain reaction,PCR)的SYTO 9染料法及TaqMan探针实时荧光定量PCR法(简称TaqMan探针法)3种检测方法的比较,旨在建立一种能够快速、准确检测24株洋葱伯克霍尔德菌群的PCR方法。方法根据NCBI数据库中24株洋葱伯克霍尔德菌的分子生物学信息,筛选出洋葱伯克霍尔德菌所特有的多个候选序列片段,设计能同时检出24株洋葱伯克霍尔德菌的特异性引物和探针,同时探索了LAMP法、基于PCR的SYTO 9染料法及Taqman探针法3种检测方法,优化筛选出最佳退火温度,并采用39株实验菌株对洋葱伯克霍尔德菌群检测方法开展了验证研究。结果采用LAMP法无法实现对洋葱伯克霍尔德菌群的有效检出,采用SYTO 9染料法和TaqMan探针法可以实现对20多株洋葱伯克霍尔德菌群的有效检出,而TaqMan探针法扩增效率更高,检测灵敏度、重复性、稳定性更好,能够满足本研究的要求。结论本研究建立了洋葱伯克霍尔德菌群的TaqMan探针快速检测方法,相较于LAMP法和SYTO 9染料法,该方法具有快速、简便和敏感性高等优点,为洋葱伯克霍尔德菌群的快速检测提供了技术支持。

主 题 词：洋葱伯克霍尔德菌群 TaqMan探针 qPCR法 

学科分类：1007[医学-药学类] 100704[100704] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.13748/j.cnki.issn1007-7693.20232897

馆 藏 号：203127877...