鸭源致病性大肠杆菌Ⅰ型菌毛pilA基因序列测定及生物信息学分析

作     者：于小娜 汪铭书 程安春 李玲 段泽 钟传德 陈孝跃 YU Xiao-na~(1,2),WANG Ming-shu~(1,2),CHEN An-chun~(1,2),LI Ling~1,DUAN Ze~1,ZHONG Chuan-de~(1,2),CHEN Xiao-yue~1(1.College of Animal and Technology,Sichuan Agricultural University,Yaan 625014,Sichuan,China;2.Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province,Yaan 625014,Sichuan,China)

作者机构：四川农业大学动物科技学院 

基　　金：四川省"十五"攻关项目(01NG018-01) 教育部"新世纪优秀人才支持计划"项目(NCET-04-0906) 四川省重点建设学科项目(SZD0418) 

出 版 物：《四川农业大学学报》 (Journal of Sichuan Agricultural University)

年 卷 期：2006年第24卷第3期

页      码：325-330页

摘      要：据GenBank中人源大肠杆菌pilA基因序列，由Oligo 6．0设计一对引物，以提取的鸭源致病性大肠杆菌基因组为模板，进行PCR扩增，获得了5株鸭源致病性大肠杆菌的pilA基因，序列测定和生物信息学分析表明：鸭源致病性大肠杆菌pilA基因核苷酸序列长度为549bp，编码182aa，与人源、鸡源及猪源大肠杆菌pilA基因之间核苷酸同源性为87．3％～100．0％，氨基酸同源性为87．5％～100．0％。对不同宿主来源大肠杆菌pilA基因所编码蛋白的二级结构、亲水性、抗原性、抗原表位进行预测分析比较，结果显示Ⅰ型菌毛间具有一定的结构相似性，并存在一定的共同抗原位点；系统进化分析表明，各菌株之间的pilA基因遗传相关性与其宿主来源及血清型之间没有严格的相关性。

主 题 词：鸭 大肠杆菌 Ⅰ型菌毛 pilA基因 PCR 序列分析 

学科分类：090603[090603] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.16036/j.issn.1000-2650.2006.03.018

馆 藏 号：203127973...