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RT-fqPCR检测腐乳耐药基因方法的建立及应用

RT-fqPCR检测腐乳耐药基因方法的建立及应用

作     者:张娜娜 刘洋 赵磊 赵燕 俞漪 ZHANG Nana;LIU Yang;ZHAO Lei;ZHAO Yan;YU Yi

作者机构:国家级上海产品质量监督检验研究院上海市质量监督检验技术研究院上海200233 

基  金:国家市场监督管理总局科技计划项目(2017QK167) 

出 版 物:《中国酿造》 (China Brewing)

年 卷 期:2024年第43卷第5期

页      码:237-241页

摘      要:该研究根据腐乳中微生物全基因组测序结果中耐药基因的丰度筛选出3种耐药基因(Baca、Emra、Imrp)设计引物,建立一种非培养方式—实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-fqPCR)方法检测不同腐乳样品中微生物可能存在的耐药基因,并对该方法的灵敏度、抗干扰能力及重复性进行检测,最后应用于市售腐乳样品中耐药基因的检测。结果表明,建立的RT-fqPCR方法对3种耐药基因检测的灵敏度较高,均达到5.4 pg;添加黄豆基因对检测结果影响不显著,抗干扰能力较好;重复性试验结果的相对标准偏差(RSD)均<1.8%,重复性较好。采用该方法对市售的47批次腐乳样品进行检测发现,3种耐药基因Baca、Emra、Imrp在腐乳中的检出率较高,分别为96.5%、92.2%和97.2%;青方腐乳、白方腐乳、红方腐乳3类腐乳含有的耐药基因分别为84.4%、83.3%和89.6%。综上,建立的RT-fqPCR方法可快速检测不同腐乳中的3种耐药基因。

主 题 词:腐乳 微生物 实时荧光定量聚合酶链式反应 耐药基因 检测 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 07[理学] 

D O I:10.11882/j.issn.0254-5071.2024.05.036

馆 藏 号:203127982...

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