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黄芪根腐病菌腐皮镰刀菌的实时荧光定量PCR检测方法建立

黄芪根腐病菌腐皮镰刀菌的实时荧光定量PCR检测方法建立

作     者:徐英芝 赵丽梅 祖未希 高芬 XU Yingzhi;ZHAO Limei;ZU Weixi;GAO Fen

作者机构:山西大学中医药现代研究中心太原030006 太原旅游职业学院酒店管理系太原030032 山西大学应用化学研究所太原030006 

基  金:山西省基础研究计划资助项目“基于LC-MS非靶向代谢组学和RT-qPCR联用挖掘黄酮类黄芪抗根腐病相关代谢物”(202103021224029) 山西省回国留学人员科研资助项目“基于路径分析的山西不同地区仿野生黄芪根腐病发病差异的微生态机制探究”(2022-023) 

出 版 物:《中国农学通报》 (Chinese Agricultural Science Bulletin)

年 卷 期:2024年第40卷第15期

页      码:110-116页

摘      要:本研究成功建立了一种针对黄芪根腐病菌腐皮镰刀菌(Fusarium solani)的实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测方法。该方法基于腐皮镰刀菌翻译延伸因子EF-1α基因序列,设计了特异性引物对FP.F/FP.R,并验证其特异性。建立腐皮镰刀菌的RT-qPCR检测方法;运用所建方法检测黄芪及土壤中腐皮镰刀菌的含量,验证其检测效果。结果表明:设计的引物FP.F/FP.R特异性强,RT-qPCR检测的灵敏度为0.0192 ng/μL,重复性评价显示方法稳定、可靠。应用该RT-qPCR方法,可从黄芪接种发病和疑似发病样本及土壤样本中检测出腐皮镰刀菌。结果表明,3组样本的总阳性检出率均为100%。同时,植株和土壤中腐皮镰刀菌的含量变化与根腐病的严重度基本一致。因此,本研究建立的RT-qPCR方法能够有效地用于黄芪植株及土壤中腐皮镰刀菌的定量检测,为根腐病的早期诊断、预警和病原菌的动态监测提供了重要的技术支持。

主 题 词:蒙古黄芪 根腐病 腐皮镰刀菌 实时荧光定量PCR 早期诊断 动态监测 

学科分类:09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 

馆 藏 号:203128276...

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