利用SSR荧光标记构建山楂种质分子身份证

作     者：秦宇 郭荣琨 农惠兰 王燕 崔凯 董宁光 QIN Yu;GUO Rongkun;NONG Huilan;WANG Yan;CUI Kai;DONG Ningguang

作者机构：中国林业科学研究院高原林业研究所昆明650223 南京林业大学林学院南京210037 北京市农林科学院林业果树研究所北京市落叶果树工程技术研究中心农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室北京100093 

基　　金：国家重点研发课题(2023YFD1000802) 北京市农林科学院科技创新能力专项(KJCX20230101,KJCX20240102) 北京市农林科学院林业果树研究所青年科研基金项目(LGSJJ202302) 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2024年第51卷第6期

页      码：1227-1240页

摘      要：以91份山楂种质资源为材料,使用SSR标记对其进行分子身份证构建,并进行遗传多样性分析。从山楂基因组数据库中开发并设计了96对引物,筛选出了12对多态性好的引物,利用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带的分子量,并分析参试样品的扩增带型。采用数字与字母组合的方式,依据12对引物的多态性信息含量由高到低排列引物扩增结果,生成各材料的指纹编码。基于非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)对91份山楂资源进行聚类分析。结果表明,12对SSR引物从91个山楂种质资源样品中共扩增到67个等位基因,其平均等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度分别为5.583、2.730、0.490、0.593,Shannon’s信息指数平均值为1.195,多态性信息含量介于0.300~0.715之间,平均为0.551。91份山楂资源的遗传相似系数范围为0.25~0.98,平均值为0.529,在遗传相似系数0.46处时可分为5大类群。根据引物的多态性信息含量高低选择引物组合,构建了山楂种质区分需要的最少引物组合。

主 题 词：山楂 种质资源 SSR荧光标记 分子身份证 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

核心收录：

D　O　I：10.16420/j.issn.0513-353x.2023-0444

馆 藏 号：203128291...