三浅裂野牵牛SnRK2基因家族的鉴定和表达分析

作     者：董静静 刘心怡 刘晓宇 赵青松 DONG Jingjing;LIU Xinyi;LIU Xiaoyu;ZHAO Qingsong

作者机构：长治学院生命科学系山西长治046011 西南大学蚕桑纺织与生物质科学学院重庆400799 

基　　金：山西省“1331工程”重点学科建设计划经费(1331KSC) 山西省高校科技创新项目(2021L523,2023L332) 

出 版 物：《山西农业科学》 (Journal of Shanxi Agricultural Sciences)

年 卷 期：2024年第52卷第4期

页      码：42-50页

摘      要：蔗糖非酵解型蛋白激酶SnRK可分为SnRK1、SnRK2和SnRK3共3个亚族,其中,SnRK2是一类仅存在于植物中的蛋白激酶,已在多种植物中得到了鉴定,其在植物生长发育、胁迫响应和信号转导中发挥了重要作用。为探究三浅裂野牵牛中SnRK2基因家族的成员并推测其功能,利用拟南芥SnRK2蛋白序列,通过生物信息学方法筛选并鉴定ItfSnRK2基因家族成员,对各成员的特征进行分析,采用转录组数据分析ItfSnRK2各成员在不同组织和非生物胁迫下的表达谱。结果发现,三浅裂野牵牛中共有7个ItfSnRK2基因,分别位于6条不同的染色体上,依据染色体排列顺序依次命名为ItfSnRK2.1~ItfSnRK2.7,它们均含有保守的激酶结构域和调节结构域。进化树分析结果显示,ItfSnRK2分为3个亚家族。基因结构分析显示,同一亚家族的成员具有相似的基因结构和保守基序组成。表达谱分析则揭示了ItfSnRK2基因具有组织表达的特异性,ItfSnRK2.2、ItfSnRK2.3、ItfSnRK2.4和ItfSnRK2.5的表达受非生物胁迫诱导,可能与抗性调节有关,以上结果为进一步了解SnRK2基因在甘薯逆境胁迫响应和信号转导中的具体功能提供了重要线索,也为甘薯的抗逆性改良提供了潜在的基因资源。

主 题 词：三浅裂野牵牛 SnRK2基因家族鉴定 生物信息学分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1002-2481.2024.04.06

馆 藏 号：203128439...