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基于环境DNA技术的红鳍笛鲷生物量评估方法研究

基于环境DNA技术的红鳍笛鲷生物量评估方法研究

作     者:辛益 邢晓东 郭禹 秦传新 于刚 马振华 王兴强 XIN Yi;XING Xiaodong;GUO Yu;QIN Chuanxin;YU Gang;MA Zhenhua;WANG Xingqiang

作者机构:江苏海洋大学海洋科学与水产学院江苏连云港222005 中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心海南陵水572426 三亚热带水产研究院海南省深远海渔业资源高效利用与加工重点实验室海南三亚572018 中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部海洋牧场重点实验室广州510300 国家渔业资源环境大鹏实验站广东深圳518120 中国水利水电第四工程局有限公司西宁810000 

基  金:海南省自然科学基金创新团队(321CXTD446) 中国水产科学研究院南海水产研究所基本科研业务费(2020SY01) 防城港市重点研发计划(防科AB21014015) 

出 版 物:《海洋渔业》 (Marine Fisheries)

年 卷 期:2024年第46卷第3期

页      码:275-285页

摘      要:环境DNA可以定量评估水生生物丰度,但其准确性因引物与构建模式差异而有所不同。以岩礁性鱼类红鳍笛鲷(Lutjanus erythropterus)为对象,采用室内实验和实时荧光定量PCR(qPCR)的方法对红鳍笛鲷引物和探针进行设计与开发,建立DNA浓度与生物量间的关系,解析环境DNA(eDNA)持久性和衰减的过程,初步探究了eDNA技术对红鳍笛鲷生物量评估的可行性。结果显示,当引物退火温度为60℃时,引物扩增效果最好;红鳍笛鲷eDNA浓度与生物量间呈显著正相关(R^(2)=0.93);移出红鳍笛鲷后的20 d内,eDNA衰减浓度与时间呈显著负相关(R^(2)=0.98)。对红鳍笛鲷增殖放流前后的水环境检测结果表明,放流后水体内红鳍笛鲷eDNA浓度显著增加,表明本研究所设计的引物在检测红鳍笛鲷生物量方面的可行性,可为应用eDNA技术开展红鳍笛鲷生物量的准确评估提供理论基础。

主 题 词:红鳍笛鲷 环境DNA 特异性引物 生物量评估 

学科分类:07[理学] 0713[0713] 

核心收录:

D O I:10.0000/SciEngine.j.MF.20240531.46.3.275

馆 藏 号:203128444...

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