基因组挖掘指导天然药物分子的发现

作     者：奚萌宇 胡逸灵 顾玉诚 戈惠明 XI Mengyu;HU Yiling;GU Yucheng;GE Huiming

作者机构：南京大学生命科学学院医药生物技术全国重点实验室江苏南京210023 南京大学化学化工学院江苏南京210023 先正达Jealott’s Hill国际研发中心英国伯克郡布拉克内尔RG426EY 

基　　金：国家重点研发计划(2018YFA0902000) 国家自然科学基金(81925033,22193071,81991522) 

出 版 物：《合成生物学》 (Synthetic Biology Journal)

年 卷 期：2024年第5卷第3期

页      码：447-473页

摘      要：天然产物是临床药物的主要来源,也是新药研发过程中先导化合物结构设计和优化的灵感源泉。但传统策略天然药源分子的发现却遭遇了瓶颈,新颖天然产物的数量逐渐无法满足现代药物开发的需求和应对全球多药耐药的威胁。随着测序技术的快速迭代,生物学的研究进入了基因组时代,基因组挖掘指导天然产物定向发现的策略得以确立,成功摆脱了传统天然产物发现策略对于生物样本生物量的依赖,极大提高了活性天然产物发现的特异性和成功率。本文简述了基因组挖掘以及相关数据库和生物信息学工具的发展,详细介绍了包括基于核心基因或后修饰基因的经典挖掘手段,自抗性机制、进化理论指导的基因组挖掘和人工智能在活性天然产物发现中的具体应用,并对基因组挖掘在药物发现和多学科交叉领域的影响和发展进行了展望。基因组信息中蕴藏着无可估量的化学潜能,促进基因组挖掘与其他学科间的交叉融合,提升对遗传信息的处理和分析能力,增强下游基因簇表达通量和产物结构预测能力,可实现天然小分子高通量、高新颖性和高效率的发现,为开发具有自主知识产权的新药物、新化学品和新型酶催化剂服务。

主 题 词：基因组挖掘 天然产物 药物发现 生物合成 人工智能 数据库 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.12211/2096-8280.2023-086

馆 藏 号：203128567...