烟草MITE位点间多态性(IMP)标记开发及其遗传作图应用

作     者：高玉龙 桂毅杰 肖炳光 薄世平 严广号 樊龙江 GAO Yu-long;GUI Yi-jie;XIAO Bing-guang;BO Shi-ping;YAN Guang-hao;FAN Long-jiang

作者机构：云南省烟草农业科学研究院云南玉溪653100 浙江大学农业与生物技术学院农学系浙江杭州310058 

基　　金：云南省科技厅资助项目(2008CD194) 云南省烟草公司资助项目(08A05) 

出 版 物：《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 (Journal of Zhejiang University:Agriculture and Life Sciences)

年 卷 期：2012年第38卷第6期

页      码：655-661页

摘      要：为在烟草(Nicotiana tabacum)上进行IMP(inter-MITE polymorphism,MITE位点间多态性)标记开发,利用美国烟草基因组测序数据和MITE(miniature inverted repeat transposable element,微型反向重复转座元件)结构特征,通过生物信息学方法获得11 581组具有特异TIR(terminal inverted repeat,末端重复元件)序列的MITE及其多序列联配结果,并根据联配结果设计219条烟草IMP引物;利用9个不同类型烟草代表性品种进行测试,其中119条引物PCR扩增成功,引物开发成功率为54.6%;进一步对一个烤烟遗传群体亲本‘红花大金元’和‘HicksBroadleaf’进行标记筛选,共获得29个多态性标记,群体检测表明有21个标记可以整合定位到一个SSR标记遗传连锁图上.说明IMP标记在烟草中是一种可以利用的分子标记,但跟其他标记一样表现出较低的多态性,需高通量检测平台与之配套来提高其开发效率.

主 题 词：烟草 微型反向重复转座元件(MITE) MITE位点间多态性(IMP) 分子标记 遗传图谱 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.3785/j.issn.1008-9209.2012.01.221

馆 藏 号：203130347...