喜盐鸢尾Na^+/H^+逆转运蛋白基因IhNHX1的克隆及序列分析

作     者：赵沿海 原海燕 顾春笋 黄苏珍 ZHAO Yanhai;YUAN Haiyan;GU Chunsun;HUANG Suzhen

作者机构：江苏省.中国科学院植物研究所(南京中山植物园)江苏省植物迁地保护重点实验室江苏南京210014 

基　　金：江苏省植物迁地保护重点实验室开放基金项目(迁201101 迁201201) 

出 版 物：《植物资源与环境学报》 (Journal of Plant Resources and Environment)

年 卷 期：2014年第23卷第2期

页      码：11-18页

摘      要：采用同源克隆和RACE法克隆获得喜盐鸢尾(Iris halophila Pall.)Na+/H+逆转运蛋白基因IhNHX1的全长序列,该基因序列的全长为1 946 bp,包含1个长度为1 611 bp的开放阅读框(ORF),编码537个氨基酸。序列对比及系统树分析结果表明:IhNHX1基因编码的氨基酸序列与另外11种植物NHX1基因编码的氨基酸序列的一致性高达96.2%,相同序列占61.7%,表明该氨基酸序列保守性较高;在系统树上喜盐鸢尾与其他植物的分支长均大于1.2,表明它们的亲缘关系均较远;IhNHX1基因编码的氨基酸序列含有2个保守结构域,即氨氯吡嗪结合位点和CaM结合结构域,分别是NHX1蛋白的标志性结合位点和重要调节区域。该蛋白质的二级结构和跨膜结构域分析结果表明:在IhNHX1基因编码的蛋白质的二级结构中,α螺旋占48.60%、不规则卷曲占32.03%、延伸链占14.71%、氢键转角占4.66%;该蛋白质含有10个跨膜结构域。此外,对5 RACE方法中5 端正向引物的优化设计步骤进行了归纳,以提高PCR扩增的特异性。

主 题 词：喜盐鸢尾 Na+ H+逆转运蛋白基因IhNHX1 基因克隆 序列分析 系统树 跨膜结构域 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1674-7895.2014.02.02

馆 藏 号：203130415...