侵染中国河北大豆的大豆花叶病毒的鉴定和全基因组序列分析

作     者：杨菲 张明振 周雪平 李方方 YANG Fei;ZHANG Mingzhen;ZHOU Xueping;LI Fangfang

作者机构：中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害综合治理全国重点实验室北京100193 河北省农林科学院植物保护研究所农业农村部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室河北省农业有害生物综合防治技术创新中心河北省作物有害生物综合防治国际科技联合研究中心保定071000 

基　　金：国家自然科学基金(31972244 32172385) 

出 版 物：《植物保护》 (Plant Protection)

年 卷 期：2024年第50卷第4期

页      码：39-47页

摘      要：本研究利用小RNA深度测序技术在河北卢龙大豆叶片上检测到6株大豆花叶病毒(soybean mosaic virus,SMV),命名为SMV-Gm1~SMV-Gm6。根据小RNA深度测序结果和参考基因组序列设计引物克隆了SMV河北分离物的基因组序列。测序结果经拼接后获得了6个SMV基因组全长序列,大小分别为9588 nt(SMV-Gm1、SMV-Gm3和SMV-Gm5)和9584 nt(SMV-Gm2、SMV-Gm4和SMV-Gm6)。开放阅读框位于基因组第132位至第9332位核苷酸,编码一个多聚蛋白(分子量约为350 kD)。BLAST比对和系统发育分析发现,SMV-Gm1、SMV-Gm3和SMV-Gm5与江苏SMV分离物(登录号:MH919386)的基因组核苷酸序列相似性最高,为98.06%~98.07%,且遗传距离较近,并与江苏、浙江和山西SMV分离物聚为一小簇;SMV-Gm2、SMV-Gm4和SMV-Gm6与韩国SMV分离物(登录号:FJ640954)的基因组核苷酸序列相似性最高,为98.48%~98.51%,且遗传距离较近。

主 题 词：大豆花叶病毒 小RNA深度测序 基因组序列 

学科分类：09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

核心收录：

D　O　I：10.16688/j.zwbh.2023325

馆 藏 号：203130859...