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微型反向重复转座元件(MITE)靶区域扩增多态性:一种基于MITE的分子标记方法在水稻及其他植物上的应用

微型反向重复转座元件(MITE)靶区域扩增多态性:一种基于MITE的分子标记方法在水稻及其他植物上的应用

作     者:马忠友 苏京平 孙林静 刘学军 王春敏 王胜军 曾斌 梁永书 闫双勇 MA Zhong-you;SU Jing-ping;SUN Lin-jing;LIU Xue-jun;WANG Chun-min;WANG Sheng-jun;ZENG Bin;LIANG Yong-shu;YAN Shuang-yong

作者机构:天津市农业科学院杂交粳稻研究中心天津300112 南京农业大学农学院江苏南京210095 

基  金:天津市农业科学院院长基金资助项目 天津市农作物研究所所长基金资助项目 

出 版 物:《中国水稻科学》 (Chinese Journal of Rice Science)

年 卷 期:2007年第21卷第5期

页      码:459-463页

摘      要:利用根据水稻微型反向重复转座元件(miniature inverted repeat transposable element,MITE)序列设计的特异引物,以及靶区域扩增多态性(target region amplification polymorphism,TRAP)方法中的随机引物及扩增程序对不同的水稻材料进行PCR扩增来检测MITE侧翼为基因区域的多态性,称之为微型反向重复转座元件靶区域扩增多态性(MITE-TRAP)。每次扩增能产生1条或多条清晰条带,条带的大小为100~1500bp,可在1.5%的琼脂糖凝胶上分离,有较好的可重复性,并发现了不同水稻品种间的多态性条带。进一步用基于水稻预测的MITE序列设计的特异引物对来自棉花、番茄及拟南芥的DNA样品进行MITE-TRAP扩增,均能成功扩增出条带,显示这种方法可以直接在其他植物中应用。还进一步讨论了该方法的优点及其可能的应用。

主 题 词:微型反向重复转座元件 靶区域扩增多态性 分子标记 引物设计 水稻 棉花 番茄 拟南芥 

学科分类:09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1001-7216.2007.05.003

馆 藏 号:203132341...

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