RT-PCR克隆籼稻叶绿素a/b结合蛋白基因全长cDNA及序列的in silico分析

作     者：袁定阳 余东 谭炎宁 孙志忠 韶也 孙学武 段美娟 Yuan Dingyang;Yu Dong;Tan Yanning;Sun Zhizhong;Shao Ye;Sun Xuewu;Duan Meijuan

作者机构：湖南杂交水稻研究中心杂交水稻国家重点实验室长沙410125 湖南省农业科学院长沙410125 中南大学研究生院隆平分院长沙410125 湖南农业大学农学院长沙410126 

基　　金：农业部转基因专项(2011ZX08001-004 2008ZX08001-001) 湖南省自然科学基金(09JJ3046) 湖南省农科院科技创新项目(2009hnnkycx17)共同资助 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2012年第31卷第2期

页      码：173-177页

摘      要：根据日本晴cab4基因序列(GenBank:AK104499.1)设计引物,用RT-PCR的方法从籼稻9311中克隆了叶绿素a/b结合蛋白基因的全长cDNA,命名为cab-9311(cab gene from 9311)。insilico分析表明:cab-9311与cab4基因同源性为99%,编码的蛋白含有244个氨基酸,与cab4基因编码的蛋白同源性为98%。蛋白分子质量为26.9kD,理论等电点为6.52。第54位～第216位氨基酸是一个典型的叶绿素a/b结合蛋白功能域(chlorophyll a/bbinding domain)。跨膜分析和蛋白质三级预测显示,该蛋白在C端有一个典型的跨膜区。亚细胞定位分析表明该蛋白定位于叶绿体,是一个叶绿体内囊体膜上的锚定蛋白。

主 题 词：水稻 叶绿素a/b结合蛋白基因 克隆 in silico分析 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D　O　I：10.3969/gab.031.000173

馆 藏 号：203134414...