绿色木霉内切几丁质酶cDNA的克隆及其编码蛋白的序列分析

作     者：于平 杨卫芳 章慧慧 YU Ping;YANG Wei-fang;ZHANG Hui-hui

作者机构：浙江工商大学食品与生物工程学院浙江杭州310035 

基　　金：浙江省自然科学基金(M303087) 浙江省科学技术厅项目(2006C23073) 杭州市科技局项目(20061133B26)资助 

出 版 物：《生物信息学》 (Chinese Journal of Bioinformatics)

年 卷 期：2013年第11卷第2期

页      码：109-114页

摘      要：根据已克隆的内切几丁质酶基因序列的同源性比较,设计引物,采用PCR技术从绿色木霉基因组中分离出一个大小为1467bp的特异DNA片段,采用RT-PCR技术从绿色木霉总RNA中分离出大小约1276bp的cDNA片段。序列对比后发现该内切几丁质酶DNA含有三个内含子,大小分别为52bp,69bp,64bp。同源性分析表明其全长cDNA序列和已经报道的内切几丁质酶序列的同源性高达95%以上,预测其编码蛋白的氨基酸序列含424个氨基酸残基,分子量为46kDa,氨基酸序列分析表明该内切几丁质酶164～172位氨基酸是其活性中心,用同源建模法模拟其空间结构模型,为进一步研究其作用机制奠定了良好基础。

主 题 词：绿色木霉 内切几丁质酶 序列分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1672-5565.2013.02.

馆 藏 号：203134878...