基于NCBI数据库的油棕EST-SSR标记的开发与应用

作     者：夏薇 肖勇 杨耀东 沈雁 雷新涛 马子龙 XIA Wei;XIAO Yong;YANG Yao-dong;SHEN Yan;LEI Xin-tao;MA Zi-long

作者机构：中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室海南文昌571339 中国热带农业科学院热带生物技术研究海南海口571101 

基　　金：国家自然科学基金(31101179) 

出 版 物：《广东农业科学》 (Guangdong Agricultural Sciences)

年 卷 期：2014年第41卷第2期

页      码：144-148,166页

摘      要：应用NCBI网站上释放的41 977条油棕EST序列,从中挖掘SSR位点3 946个,根据27个SSR位点的侧翼序列设计引物,并对18份油棕DNA样品进行扩增,扩增结果显示10个标记具有多态性。根据这些标记信息,对这18份油棕资源进行主成分分析,18份油棕资源被分成两个遗传群体,一个为文昌高隆湾和文昌椰子研究所的油棕资源,另一个群体为10份引自马来西亚的油棕资源。这些研究显示,开发的标记可用于油棕资源遗传多样性评估、遗传结构评估,并可用于油棕遗传图谱的构建。

主 题 词：油棕 SSR 多态性 平均遗传距离 遗传结构 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1004-874X.2014.02.034

馆 藏 号：203135016...