现代月季Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析

作     者：李文天 杨涛 张晓莹 陈帅 李洲 车代弟 Li Wentian;Yang Tao;Zhang Xiaoying;Chen Shuai;Li Zhou;Che Daidi

作者机构：东北农业大学园艺学院哈尔滨150030 

基　　金：高等学校博士学科点专项科研基金项目(20122325110007)资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2014年第12卷第6期

页      码：1216-1221页

摘      要：本研究以8个现代月季品种为试验材料,根据Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从现代月季基因组中扩增出260 bp左右的目标条带。将扩增产物纯化后克隆于p MD18-T质粒载体,选择阳性克隆,再经菌落PCR鉴定、测序及序列分析,获得19条来源于现代月季的Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列。研究发现这些序列的核苷酸长度集中于258~268 bp,存在较高的异质性,同源性范围3.4%~81.6%,主要表现在缺失突变,通过核苷酸聚类分析分为四类家族。翻译成氨基酸后,发现存在移框突变和终止密码子突变的现象,将这19条来源于现代月季的逆转录酶序列与登录在NCBI上来自于其它植物的Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的氨基酸序列聚类分析,结果表明现代月季与其它物种间具有较高的同源性,表明Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列在不同物种之间可能存在横向传递。

主 题 词：现代月季 Ty1-copia类逆转录转座子 逆转录酶 异质性 

学科分类：090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

D　O　I：10.13271/j.mpb.012.001216

馆 藏 号：203135067...