部分柿属植物TRAP标记反应体系的建立与引物筛选

作     者：罗纯 吴迪 张青林 罗正荣 LUO Chun;WU Di;ZHANG Qing-lin;LUO Zheng-rong

作者机构：华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室湖北武汉430070 农业部热带果树生物学重点实验室/中国热带农业科学院南亚热带作物研究所广东湛江524091 

基　　金：国家自然科学基金(31171929) 公益性行业(农业)科研专项(201203047) 

出 版 物：《江西农业学报》 (Acta Agriculturae Jiangxi)

年 卷 期：2014年第26卷第9期

页      码：1-5页

摘      要：为了建立柿属植物目标区域扩增多态性(TRAP)标记技术体系,对影响TRAP-PCR的Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶、固定引物和随机引物浓度比5个因素进行了优化。确定优化的反应体系为:模板DNA 40 ng,buffer 1×,Mg2+1.4 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,固定引物和随机引物浓度比为11∶1,Taq酶0.5 U,反应总体积为15μL。利用柿属植物EST数据库信息设计锚定引物10条,与11条随机引物组合共110对引物。利用这些引物对柿属植物6个基因型进行TRAP-PCR扩增,其中84个引物组合能扩增出清晰条带,占引物总量的76.36%;36个引物组合表现出良好的多态性扩增,并在20份柿属植物中进行了引物验证。

主 题 词：柿属植物 TRAP 反应体系优化 引物筛选 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071001[071001] 07[理学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1001-8581.2014.09.001

馆 藏 号：203135563...