基于正交试验设计优化三疣梭子蟹SRAP-PCR反应体系

作     者：胡则辉 徐君卓 王跃斌 柴学军 HU Zehui;XU Junzhuo;WANG Yuebin;CHAI Xuejun

作者机构：浙江省海洋水产研究所浙江省海水增养殖重点实验室浙江舟山316100 

基　　金：浙江省重大农业科技专项(2007C12024) 

出 版 物：《南方水产》 (South China Fisheries Science)

年 卷 期：2010年第6卷第5期

页      码：68-73页

摘      要：相关序列扩增多态性（sequence related amplified polymorphism,SRAP）是一种多态性高的新型分子标记,其扩增结果稳定,容易操作和引物通用性高,在遗传多样性分析、种质鉴定和遗传图谱构建等方面的广泛应用逐渐从植物转移到水产动物中。为了建立三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）SRAP技术体系,文章利用正交设计L16（45）对三疣梭子蟹SRAP-PCR反应体系的5因素[TaqDNA聚合酶、镁离子（Mg2＋）、模板、三磷酸脱氧核苷（dNTPs）和引物]在4个水平上进行优化试验,结果得出各因素水平变化对PCR反应的影响从大到小依次为模板（纯度1.75~1.90,质量浓度10~70ng.μL-1）,Mg2＋（1.60~2.00mmol.L-1）,dNTPs（0.10~0.40mmol.L-1）,TaqDNA聚合酶（0.50~2.00U）和引物（0.10~0.40μmol.L-1）;筛选出各反应因素的最佳水平,建立三疣梭子蟹SRAP-PCR反应的最佳体系（25μL）为TaqDNA聚合酶0.50U,Mg2＋2.20mmol.L-1,模板DNA10ng,dNTPs0.20mmol.L-1,引物0.20μmol.L-1。这一优化体系可望在三疣梭子蟹遗传多样性和性别连锁标记等研究中应用。

主 题 词：三疣梭子蟹 SRAP 正交设计 优化 

学科分类：0908[0908] 09[农学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1673-2227.2010.05.011

馆 藏 号：203136396...