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禽传染性支气管炎病毒SAIBk株全基因组的分段克隆、测序及分析

禽传染性支气管炎病毒SAIBk株全基因组的分段克隆、测序及分析

作     者:周生 王红宁 唐梦君 黄勇 柳萍 ZHOU Sheng;WANG Hong-ning;TANG Meng-jun;HUANG Yong;LIU Ping

作者机构:四川农业大学动物科技学院动物预防医学生物工程实验室雅安625014 

基  金:国家"863计划"(2003AA241120) 

出 版 物:《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期:2007年第38卷第1期

页      码:72-77页

摘      要:根据GenBank上公布的IBV基因组序列,经多重比较后设计19对引物,用RT-PCR方法对禽传染性支气管炎病毒致肾病变型分离株SAIBk株的全基因组进行了分段扩增、克隆和序列测定。测序结果表明:SAIBk株基因组序列全长27520 bp,A+T的含量占61.74%,具有典型的冠状病毒基因组结构。基因组内碱基的插入和缺失主要分布在3 220-3470位、20560-20810位、25310-25600位和27150—27220位。与GenBank上公布的5株IBV基因组序列Beaudette、Mass41、Ca199、BJ、KQ6的同源率分别为87.2%、87.6%、87.2%、85.6%和87.5%。SAIBk株基因组不同区域的同源性分析结果表明,3'UTR和5'UTR是基因组中最为保守的区域,同源率在90.9%~97.7%,而S1基因是基因组中变异最大的区域,同源率在74.8%~83.2%。系统进化分析结果表明SAIBk株与国内分离株S14、LX4、BJ的亲缘关系较近。

主 题 词:禽传染性支气管炎病毒 致肾病变型 基因组 序列分析 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:0366-6964.2007.01.013

馆 藏 号:203139329...

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