旋毛虫组织蛋白酶B基因TsCB1的克隆与生物信息学分析

作     者：谢志宙 李文卉 曲自刚 刘静宜 高小磊 岳龙 张德林 付宝权 

作者机构：中国农业科学院兰州兽医研究所 家畜疫病病原生物学国家重点实验室 农业部兽医公共卫生重点开放实验室 甘肃省动物寄生虫病重点实验室甘肃兰州730046 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(31272555) 甘肃省创新研究群体计划项目(1210RJIA006) 

出 版 物：《中国兽医科学》 (Chinese Veterinary Science)

年 卷 期：2013年第43卷第7期

页      码：661-667页

摘      要：为了研究旋毛虫组织蛋白酶B的功能,对GenBank中旋毛虫基因组数据库和EST数据库进行检索,获得旋毛虫组织蛋白酶B的cDNA序列并设计引物。以旋毛虫肌幼虫总RNA为模板,进行RT-PCR,将PCR产物克隆到pMD18-T载体后测序并进行生物信息学分析。结果表明,成功克隆到旋毛虫组织蛋白酶B基因(TsCB1)的cDNA序列,TsCB1cDNA含有1个由1 449个核苷酸组成的完整的开放阅读框,编码482个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质分子质量理论值为55.1ku,理论等电点为7.66。TsCB1第1～35位氨基酸残基为信号肽序列,有2个潜在的N-糖基化位点,具有1个生长调节素B结构域和半胱氨酸蛋白酶结构域,半胱氨酸残基活性位点被丝氨酸残基所替换,同源性分析表明与其他线虫组织蛋白酶B的一致性在60%左右。

主 题 词：旋毛虫 组织蛋白酶B 克隆 生物信息学分析 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录：

D　O　I：10.16656/j.issn.1673-4696.2013.07.010

馆 藏 号：203139605...