条斑紫菜(Porphyra yezoensis)dbEST中筛选微卫星位点及引物种间转移扩增

作     者：刘必谦 曾庆国 骆其君 王亚军 厉盛华 LIU Bi-qian;ZENG Qing-Guo;LUO Qi-Jun;WANG Ya-Jun;LI Sheng-hua

作者机构：宁波大学海洋生物工程重点实验室宁波315211 宁波海洋与渔业研究院宁波315012 

基　　金：国家自然科学基金(49976030)资助 宁波市重点基金(02J2010115)资助 

出 版 物：《海洋与湖沼》 (Oceanologia Et Limnologia Sinica)

年 卷 期：2005年第36卷第3期

页      码：248-254页

摘      要：采用电子查询的方法,借助Blast软件从条斑紫菜表达序列标签数据库的20979条序列中筛选微卫星位点,共发现非冗余微卫星位点211个,占整个条斑紫菜EST数据库的1.01%。其中双碱基重复微卫星位点共有35个,占查找微卫星序列总数的16.6%;三碱基微卫星有176个,占83.4%。双碱基重复微卫星中AG/CT形式最多,而三碱基中GGC/GCC最多。从筛选出的微卫星位点中选取序列设计合成引物,用在坛紫菜上进行引物种间转移扩增研究。在总共15对引物中有13对引物在两个种间都有扩增产物。结果表明,微卫星位点在这两种紫菜之间具有很高的同源性。获得的微卫星引物可用来进行种群遗传多样性研究、谱系鉴定和遗传图谱的构建。而微卫星标记的共显性可用来进行紫菜二倍体丝状体纯合性检验,为纯系紫菜品系的鉴定提供分子生物学鉴定方法。

主 题 词：条斑紫菜,表达序列标签,微卫星,种间转移扩增 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:0029-814X.2005.03.009

馆 藏 号：203140740...