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奇异变形菌基因组文库的构建及标识序列的发现

奇异变形菌基因组文库的构建及标识序列的发现

作     者:赵瑾 陈泽良 王玉飞 乔凤 杜昕颖 张伶 黄留玉 ZHAO Jin;CHEN Ze-Liang;WANG Yu-Fei;QIAO Feng;DU Xin-Ying;ZHANG Ling;HUANG Liu-Yu

作者机构:军事医学科学院疾病预防控制所北京100071 

基  金:国家自然科学基金资助项目(30600024) 

出 版 物:《军事医学科学院院刊》 (Bulletin of the Academy of Military Medical Sciences)

年 卷 期:2008年第32卷第2期

页      码:126-128,143页

摘      要:目的:构建用于筛选奇异变形菌的特异序列的基因组文库,并从中筛选变形杆菌特异的标识序列。方法:提取奇异变形菌的基因组DNA,用Sau3AI部分酶切,回收酶切产物,然后与BamHI酶切的pUC19质粒连接,转化JM109,构建奇异变形菌的基因组文库。随机挑取抗性克隆,用位于质粒上的引物进行扩增,确定插入片段的大小及分布情况。DNA测序确定部分克隆中插入的序列,根据序列设计引物,分析这些序列在奇异变形菌临床分离株中的分布,验证序列的特异性。结果:成功构建了奇异变形菌的基因组文库,库容量达到1.1×10^5CFU。阳性克隆的比例为95%,插入片段大小主要分布在200~500bp的范围。对其中14个克隆进行了序列测定,其中5个片段与已知序列有一定的同源性,另外9个与已知序列没有同源性,特异性分析发现了几个较好的标识序列。结论:成功构建了奇异变形菌的基因组文库,利用该文库发现了奇异变形菌特异的序列。

主 题 词:变形杆菌,奇异 基因组文库 序列分析 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1674-9960.2008.02.006

馆 藏 号:203140952...

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