油桐ACPase基因克隆及生物信息学分析

作     者：刘美兰 谭晓风 袁军 周俊琴 LIU Mei-Lan;TAN Xiao-feng;YUAN Jun;ZHOU Jun-Qin

作者机构：中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室长沙410004 

基　　金：国家林业公益性行业科研专项项目(200904023) 

出 版 物：《南方农业学报》 (Journal of Southern Agriculture)

年 卷 期：2014年第45卷第3期

页      码：339-344页

摘      要：【目的】克隆油桐酸性磷酸酶（ACPase）基因的全长序列，为进一步分析油桐ACPase的功能奠定基础。【方法】根据油桐转录组酸性磷酸酶蛋白全长序列设计引物，利用RT-PCR从油桐种子中克隆ACPase基因，对其cDNA序列、核苷酸序列的相似性、理化性质、疏水性、跨膜结构、二级结构及三级结构进行分析预测，同时进行多序列比对并构建系统树。【结果】克隆获得油桐ACPase基因，其开放阅读框为1152 bp，编码383个氨基酸残基，相对分子质量为40.94 kDa，理论pI为5.30，属可溶性不稳定蛋白。同源性和进化树的预测分析结果显示，油桐ACPase与毛果杨的ACPase蛋白同源性达84%。油桐ACPase存在磷酸酶基因家族的保守区域，ACPase编码蛋白的大部分氨基酸属于亲水性氨基酸。其蛋白二级结构主要由不规则卷曲、α-螺旋和β-折叠构成。ACPase蛋白包含1个跨膜螺旋区域，其相应氨基酸位置在136-156；包含1个疑似跨膜域，其相应氨基酸位置在255-275；每个跨膜结构域为由20个氨基酸残基组成的螺旋，同时跨膜蛋白的N端和C端位于细胞膜胞质的一侧。【结论】油桐ACPase基因的表达可能与其体内磷营养的分解利用等过程有关。

主 题 词：油桐 酸性磷酸酶 ACPase 克隆 生物信息学 

学科分类：0907[农学-草药学] 08[工学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.2095-1191.2014.3.339

馆 藏 号：203141170...