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水体中盐单胞菌属(Halomonas)细菌实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

水体中盐单胞菌属(Halomonas)细菌实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

作     者:张艳 李秋芬 成钰 费聿涛 姜娓娓 ZHANG Yan;LI Qiufen;CHENG Yu;FEI Yutao;JIANG Weiwei

作者机构:中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛266071 

基  金:国家自然科学基金项目(31170113) 海洋公益性行业科研专项经费项目(201305043) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(20603022013019)资助~~ 

出 版 物:《应用与环境生物学报》 (Chinese Journal of Applied and Environmental Biology)

年 卷 期:2016年第22卷第1期

页      码:140-145页

摘      要:通过制备标准曲线模板,针对一株盐单胞属细菌X3(经鉴定为Halomonas alkaliphila)的16S r DNA序列设计和筛选特异性引物,建立水体中盐单胞菌属细菌的实时荧光定量PCR检测方法,并将该法用于检测莱州人工鱼礁海域Halomonas属细菌数量.结果表明,引物X3-3F和X3-3R能够对Halomonas属的细菌进行特异性检测,对细菌浓度为6.75×10^-1-6.75×10^7 CFU/m L检测重复性和稳定性较好,最低检出浓度为67.5 CFU/m L.运用建立的方法对莱州人工鱼礁海域水体样品的检测结果表明,在未投礁海域2011年5月和7月水体样品中Halomonas细菌数量分别为8.71×10^3 CFU/m L和2.37×10^3 CFU/m L,而投礁区5月份水样也检出了该属细菌,但荧光信号较弱,7月份水样未检出该属细菌.本研究可为Halomonas属细菌的快速检测及其在海水养殖水质净化方面的推广应用提供有力的技术支撑.

主 题 词:异养硝化-好氧反硝化细菌 Halomonas sp. 实时荧光定量PCR 人工鱼礁 

学科分类:082803[082803] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 0830[工学-生物工程类] 1001[医学-基础医学] 0828[工学-建筑类] 0804[工学-材料学] 0903[农学-动物生产类] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 0713[0713] 

核心收录:

D O I:10.3724/sp.j.1145.2015.02019

馆 藏 号:203141259...

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