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HRM技术快速检测新冠病毒变异株

HRM技术快速检测新冠病毒变异株

作     者:周玉真 程悦 谢汶君 何迅 沈丹芸 陈恒 ZHOU Yuzhen;CHENG Yue;XIE Wenjun;HE Xun;SHENG Danyun;CHEN Heng

作者机构:中国医学科学院成都新发突发传染病防治工作站成都610000 成都市疾病预防控制中心成都610000 

基  金:四川省医学青年创新科研课题计划(项目号:Q22017),题目:新型冠状病毒宿主内适应性进化及其应用研究 2022年成都市医学科研课题(项目号:2022056),题目:基于突变位点库的新冠病毒变异株快速检测及溯源平台 

出 版 物:《病毒学报》 (Chinese Journal of Virology)

年 卷 期:2024年第40卷第5期

页      码:1076-1081页

摘      要:建立基于高分辨率融解曲线(High resolution melting,HRM)的快速检测新冠病毒变异株的方法,为新冠变异株快速检测提供技术支撑。针对新冠病毒S基因的氨基酸突变位点G339H/D、D796Y、V83A设计HRM引物,将新冠病毒实时定量荧光PCR(RT-PCR)阳性的核酸逆转录后进行HRM分析,并对33份新冠病毒RT-PCR阳性核酸标本进行检测,与二代测序结果进行比较。建立的HRM方法能区分Delta、Omicron及XBB亚型,33份标本的HRM分析结果显示其中2份为Delta株,31份为Omicron株,12份为XBB亚型。HRM分析结果与二代测序结果一致。本实验建立的HRM方法能够准确检测出新冠病毒变异株中的Delta、Omicron及XBB亚型,可应用于快速鉴定新冠病毒型别。

主 题 词:新冠变异株 高分辨率融解曲线 德塔尔株 奥密克戎株 XBB 

学科分类:1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004576

馆 藏 号:203141308...

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